Modificações na estrutura da comunidade fitoplanctônica são indicadores sensíveis de alterações naturais ou antrópicas nos mananciais hídricos. a dinâmica do fitoplâncton em ambientes lênticos é controlada por uma interação complexa entre hidrodinâmica, fatores químicos, disponibilidade de luz e herbivoria. as cianobactérias, grupo de extrema importância no fitoplâncton, apresenta ampla distribuição ecológica e geográfica, diferindo substancialmente em termos de atributos funcionais, sendo difícil determinar as condições gerais que promovem suas florações. persistem, assim, diversas lacunas do conhecimento sobre a estruturação da comunidade fitoplanctônica sob uma condição de prolongada dominância de cianobactérias. a lagoa do peri apresenta mistura permanente, exibindo isotermia e homogeneidade dos recursos nutricionais ao longo da coluna d’água. além disso, a constante circulação limita a penetração luminosa, promovendo seleção competitiva das espécies fitoplanctônicas com menores requerimentos de luz. apesar de apresentar caráter espacialmente homogêneo, a temperatura da água teve uma grande variação sazonal, sendo reconhecida nas análises como uma das variáveis mais determinantes na estruturação do sistema estudado, gerando alternância entre a predominância de poucas espécies. de maneira geral, a diversidade da lagoa do peri foi baixa, devido principalmente à dominância por poucas espécies de cianobactérias. os grupos funcionais (sensu reynolds) selecionados pelo ambiente foram constituídos predominantemente de cianobactérias adaptadas à baixa luminosidade, intensa mistura e temperaturas elevadas. os nutrientes se mantiveram em níveis considerados limitantes ao crescimento fitoplanctônico, entretanto, tal condição pode configurar uma possível vantagem para as espécies descritoras da lagoa do peri. ainda, a baixa concentração de nutrientes dissolvidos do sistema pode estar associada a uma rápida incorporação deste recurso pelas espécies predominantes, já que apresentam habilidades em otimizar o emprego do mesmo. além disso, a presença eminente da espécie fixadora de nitrogênio cylindrospermopsis raciborskii foi observada em alta proporção em toda a série temporal, com elevada densidade de heterocitos. assim, a fixação de nitrogênio parece estar exercendo papel crucial para o sucesso da espécie. as análises realizadas indicaram que os fatores físicos da água foram os principais condutores da dominância das populações de cianobactérias no sistema. de maneira geral, a estrutura e dinâmica do fitoplâncton da lagoa do peri demonstraram estar relacionadas à limitação por luz e nutrientes dissolvidos - direcionados pelos padrões de mistura - somados a um amplo gradiente temporal de temperatura, promovendo o sucesso de espécies adaptadas a este cenário. como seria de esperar, considerando-se a localização subtropical da lagoa, os padrões temporais do fitoplâncton parecem ser menos dependentes da sazonalidade, do que em habitats de clima temperados, e mais estreitamente ligados às variações das condições climáticas locais.