A atividade leiteira no oeste de santa catarina tem sido, nos últimos anos, o principal meio de geração de renda para muitos agricultores familiares. na região, há um grande número de produtores que adotam o sistema de produção a pasto associado ao uso de suplementos (concentrado e/ou volumoso) e um crescente número de propriedades de base ecológica, algumas já com certificação orgânica. sendo assim, o objetivo do presente trabalho foi comparar a qualidade química, sanitária e microbiológica do leite proveniente da pecuária de base ecológica com a convencional na região oeste de santa catarina. a caracterização do sistema de produção foi obtida a partir de visitas e entrevistas semi-estruturadas. para a avaliação da composição química do leite foram realizadas 2 coletas, nas diferentes estações do ano, de 3 animais pré-selecionados de fenótipo (cruzamento jersey x holandês) e de estágio de lactação similares (3 a 6 meses) e para a qualidade sanitária e microbiológica dos tanques de resfriamento em cada unidade de produção familiar (upf) em estudo. realizou-se também a identificação botânica das espécies forrageiras consumidas a partir da observação dos animais em pastoreio. os sistemas diferiram na sua configuração produtiva, tendo as upfs convencionais maior área total da propriedade, área de pastagens para espécies anuais (apa), número de animais em lactação e produção de leite e as de base ecológica maior área destinada para espécies perenes (app). nestas, observou-se pastagens mais diversificadas em todas as estações, especialmente no inverno e primavera. enquanto penisetum americanum e sorghum sudanensis predominaram nas upfs convencionais no verão, avena sativa e lolium multiflorum, foram as espécies usadas para a produção de leite nas outras estações do ano. além disso, verificou-se correlação positiva (r2=0,74, p<0,05) entre a % da app e o número médio de espécies forrageiras consumidas. a despeito das diferenças de composição botânica e manejo alimentar entre os tratamentos, o valor nutricional do leite de base ecológica não diferiu do convencional, à exceção dos maiores teores de gordura no inverno. os teores de proteina, lactose e extrato seco desengordurado diferiram apenas entre as estações do ano. além disso, a composição química do leite, mostrou-se dentro dos parâmetros permitidos pela in62, à exceção dos teores de extrato seco desengordurado (inverno) e lactose (outono) em todos os tratamentos. da mesma forma, não se verificou influência do sistema de produção sobre a qualidade sanitária e microbiológica do leite. entretanto, foram encontrados valores de ccs e cbt acima do permitido pela in62 em várias upfs. no outono e primavera, 50% e 58,33% das upfs, respectivamente, tinham um valor de cbt acima do permitido pela in62. o mesmo foi observado para ccs, com 41,67% (inverno) e 33,33% (verão) das upfs em desacordo com as exigências da legislação. esses resultados sugerem a necessidade de melhorias na higiene e manejo da ordenha nas upfs em estudo. a análise multivariada dos dados através da aplicação da análise dos componentes principais (pca), de todos os parâmetros estudados, mostrou que o sistema de produção empregado nas upfs de base ecológica diferiu do convencional, sendo a maior % da apa e app os fatores responsáveis pela discriminação das upfs de base ecológica das convencionais. em conjunto, os resultados encontrados indicaram que a qualidade do leite produzido por agricultores familiares no oeste catarinense não foi afetada pelo sistema de produção, embora estes tenham-se diferenciado claramente na sua configuração produtiva.