Com a crescente preocupação a respeito da poluição hídrica e as possíveis doenças que possam ser causadas através da contaminação com protozoários, surge a filtração em margem como uma das possíveis soluções para o problema, já que pode remover através de filtração os organismos que são resistentes a desinfecção química e algumas vezes podem acabar atingindo as redes de distribuição. sendo assim, este trabalho objetivou avaliar a eficiência da filtração em margem em colunas de sedimento para remoção de cryptosporidium spp. através do uso microesferas de poliestireno para simulação deste protozoário. para consecução desta pesquisa, foi realizado um estudo contendo 5 colunas filtrantes a fim de simular os primeiros metros da filtração em margem, onde foram aplicadas as microesferas simuladoras do protozoário cryptosporidium spp. previamente a aplicação das microesferas, procurou-se identificar a quantidade de tempo necessária para que o sistema piloto fosse considerado aclimatado. o controle da qualidade da água produzida pela filtração em margem foi realizado através do monitoramento dos seguintes os parâmetros: carbono orgânico total, coliformes totais, condutividade, cor aparente, cor verdadeira, e. coli, oxigênio dissolvido, ph, sólidos dissolvidos totais, temperatura e turbidez. a análise das microesferas de poliestireno foi realizada em microscópio de fluorescência. com base nos resultados obtidos, considera-se aclimatado o sistema piloto após 45 dias de operação, pois nessa altura já é possível alcançar resultados suficientemente bons para se enquadrarem na portaria nº 2914/2011. foi também possível concluir que a filtração em margem mostrou-se efetiva na remoção de microesferas de poliestireno a partir de 3 m de leito filtrante. no que diz respeito a turbidez como indicador da presença de cryptosporidium spp., considera-se que este não corresponde a um indicador confiável, pois houve a presença das microesferas de poliestireno até mesmo quando a turbidez alcançava valores menores que 0,5 ut, como recomenda a legislação brasileira.