A drenagem ácida de mina de carvão (dam) é o impacto mais significativo na região carbonífera do estado de santa catarina, tendo a oxidação da pirita (fes2) como o principal responsável por desencadear tal impacto. a água derivada da mineração, do processamento e dos rejeitos apresentam ph baixo (<3) e elevados níveis de metais pesados, afetando severamente as bacias hidrográficas e o solo. os métodos convencionais estabelecidos para remediar esse ambiente contaminado são frequentemente caros, invasivos e não fazem uso eficaz dos recursos existentes. dessa maneira, a fitorremediação tem se mostrado uma boa candidata, apresentando uma excelente relação custo benefício, uma alternativa de remediação sustentável, exigindo o mínimo de intervenção e manutenção. no entanto, as condições impostas pela dam dificultam o estabelecimento de plantas nesse ambiente, sendo que, uma das formas encontradas pelos vegetais para contornar essa situação é através do estabelecimento de associação com bactérias, que podem trazer benefícios às mesmas, como por exemplo, a remoção dos metais pesados. desta forma, o objetivo deste trabalho foram identificar e caracterizar microrganismos endofíticos que possam ser utilizados em processos de fitorremediação. para tanto, foram coletadas amostras de tecidos vegetais de quatro espécies diferentes de plantas em siderópolis (local impactado pela dam) e florianópolis (local não impactado) entre julho de 2012 a março de 2013. foram isolados 192 microrganismos endofíticos, sendo 114 bactérias e 78 fungos. dentre os isolados obtidos, apenas as bactérias endofíticas foram identificadas e caracterizadas quanto à resistência a metais pesados, fixação de nitrogênio e solubilização de fosfato inorgânico. por meio do sequenciamento parcial do gene 16s rrna, foram identificadas 94 bactérias. dentre essas, 44 bactérias são provenientes de siderópolis e 50 de florianópolis, sendo os isolados agrupados em seis classes filogenéticas: acidobacteriales, actinobacteridae, alphaproteobacteria, bacilli, betaproteobacteria e gammaproteobacteria. os resultados demonstraram que dos isolados avaliados, pelo menos 20 apresentaram capacidade em tolerar elevadas concentrações dosíons metálicos zn2+, pb2+ e cd2+. além disso, outras 14 cepas apresentaram habilidade em solubilizar fosfato inorgânico e um isolado apresentou o gene nifd, responsável pela fixação de nitrogênio atmosférico. três bactérias se sobressaíram nos testes realizados, sendo elas lama 1146 - bacillus sp., lama 1170 - serratia marcescens e lama 1179 - brevibacillus borstelensis. as bactérias identificadas nesse trabalho têm potencial para aplicação em processos de fitorremediação.