A formação dos profissionais de saúde traz reflexos diretos para o desenvolvimento de sistemas públicos de saúde. desta forma, o processo de formação no brasil enfrenta o desafio da transformação e está sendo direcionado para o enfrentamento das necessidades do sistema único de saúde (sus). atualmente, existem políticas e ações de educação direcionadas para a atuação no sus, sendo o programa nacional de reorientação da formação profissional em saúde (pró-saúde) e o programa de educação pelo trabalho em saúde (pet-saúde) exemplos dessa iniciativa. além disso, as diretrizes curriculares nacionais (dcns), que orientam atualmente a graduação em farmácia, estabelecem competências e habilidades necessárias para o exercício da profissão e representam documento norteador com recomendações ou orientações às instituições de ensino para elaboração dos projetos políticos pedagógicos dos cursos (ppcs). o presente estudo se propõe a analisar a apropriação das dcns pelos cursos de graduação em farmácia do sul do brasil, bem como o papel do pet-saúde na formação de farmacêuticos, visando atuação nos serviços farmacêuticos do sus. foi realizada análise documental das matrizes curriculares e ppcs de farmácia de instituições de ensino superior públicas e privadas do rio grande do sul, santa catarina e paraná, além de entrevista semiestruturada com estudantes e professores de cursos de farmácia de santa catarina. os dados analisados possibilitaram concluir que a oferta de bases teóricas e práticas de aproximação com o sus se mostraram bastante desiguais entre os cursos, sendo fundamental repensar criticamente as dcns e as formas pelas quais vêm sendo implementadas entre as escolas de farmácia do país. os principais resultados também apontam que o programa pet-saúde contribui positivamente na formação de farmacêuticos com perfil mais adequado para atuação no sistema. no entanto, as dificuldades encontradas sinalizam para a necessidade de uma relação ensino-serviço mais sólida e de responsabilização mútua, permitindo desta forma o aproveitamento para os sistemas de saúde e de educação.