A crescente presença de novos produtos alimentícios no mercado desperta discussões relacionadas à segurança de alimentos. cada país ou região tem suas próprias leis para liberação de novos alimentos para consumo, porém existe um consenso internacional no que diz respeito às regulamentações para segurança do consumo destes produtos, inclusive de alimentos provenientes de tecnologia de dna recombinante. o conceito de equivalência substancial tem sido utilizado com este fim, fundamentado no fato de que os alimentos já existentes no comércio são admitidos como seguros para o consumo e servem como base para comparação por meio de análises de componentes específicos. apesar de convenientes, estas análises-alvo são bastante limitadas por pesquisarem a presença de somente alguns elementos previamente conhecidos. deste modo, abordagens mais completas para avaliação de alimentos têm sido propostas, como análises transcriptômica e proteômica. como estas análises geram um grande volume de dados, enfoques utilizando análise estatística multivariada têm sido sugeridos para interpretação dos resultados. neste trabalho verificou-se a aplicação de ferramentas estatísticas multivariadas para análises transcriptômica (microarranjo) e proteômica (eletroforese bidimensional) com vistas à sua utilização como análise complementar na avaliação de segurança de novos alimentos. para isso, analisaram-se cinco variedades de batatas reconhecidas como seguras para consumo (biogold, fontane, innovator, lady rosetta e maris piper). as análises do transcriptoma das amostras revelaram que foi possível a classificação das amostras utilizando a ferramenta simca com uma classe. foram desenvolvidos dois cenários contendo um conjunto de cinco classificadores e, em cada cenário, foram testadas duas amostras independentes sabidamente seguras, porém analisadas em diferentes momentos (incluindo, assim, variabilidade técnica no teste). em cada conjunto de classificadores, as amostras teste que foram mais vezes classificadas como não pertencentes aos modelos (ou seja, não classificadas como seguras) representam as amostras com maior variabilidade técnica, pois foram cultivadas e analisadas em tempos diferentes daquelas utilizadas para a construção dos classificadores. já as amostras que foram reconhecidas como seguras na maioria dos classificadores possuem menor variabilidade técnica. foi também realizada a análise proteômica por eletroforese bidimensional destas amostras. utilizou-se tiras de gradiente de ph imobilizado (ipg) de dois comprimentos diferentes, 13 e 24 cm, todas na faixa de ph de 4-7, e os conjuntos de dados gerados, representando a % de volume de spots (tendo os valores omissos substituídos ou simplesmente eliminados), foram visualizados por diagramas de análise de componentes principais (pca). foi verificada clara separação das variedades já nos dois primeiros componentes principais do conjunto de dados contendo valores omissos substituídos. estes resultados revelam a possibilidade de se construir ferramentas de classificação por técnicas de análise ampla de perfil como a transcriptômica e proteômica, explorando assim uma nova abordagem para avaliação de segurança de alimentos. para aprimorar o trabalho, a análise de um maior número de amostras permitirá maior precisão dos resultados, incluindo-se assim um alto nível de variabilidade técnica na construção dos classificadores. desta forma, será possível a reprodução em pequena escala de situações reais de avaliação de segurança de alimentos.