A morfologia geral da subtribo pleurothallidinae tem sido bem descrita, porém a falta de trabalhos anatômicos atuais reflete a grande lacuna na interpretação das sinapomorfias, ainda mais evidente quando se trata de representantes da rica flora brasileira, com elevado grau de endemismo. assim, dando continuidade aos trabalhos de cunho descritivo, este estudo examinou a anatomia radicular de 56 espécies distribuídas em 11 gêneros pertencentes à subtribo pleurothallidinae (orchidaceae), sob microscopia de luz e microscopia eletrônica de varredura, a fim de identificar caracteres diagnósticos que possam ser utilizados na distinção entre os gêneros e espécies, auxiliando futuros trabalhos de taxonomia e sistemática do grupo. os gêneros distinguem-se principalmente pelas características do complexo velame/exoderme e do cilindro central. acianthera apresenta velame biestratificado com espessamento em "u" no epivelame, exoderme espessada em "o" e em "u" invertido, e medula esclerificada ou parenquimática. anathallis apresenta velame biestratificado com espessamento em "u" no epivelame ou velame pluriestratificado com até quatro camadas, com espessamento reticulado no epivelame e helicoidal no endovelame, tilossomo do tipo baculado e lamelar, exoderme com paredes finas e medula esclerificada. echinosepala apresenta velame pluriestratificado com até quatro camadas com espessamento anastomosado, exoderme espessada em "o", e medula parenquimática. masdevallia apresenta velame pluriestratificado com até seis camadas com paredes perforadas, exoderme com paredes finas, e medula esclerificada. myoxanthus apresenta velame biestratificado com espessamento em "u" no epivelame, velame com duas a três camadas, ou velame pluriestratificado com até quatro camadas, exoderme com paredes finas, e medula parenquimática. octomeria apresenta velame com duas a três camadas com espessamento reticulado e anastomosado, exoderme espessada em "u" invertido, e medula esclerificada. pabstiella apresenta velame biestratificado com epivelame espessado em "o", tilossomos, exoderme com paredes finas e medula esclerificada. pleurothallis apresenta velame biestratificado, ou velame com duas a três camadas com espessamento reticulado no epivelame e helicoidal no endovelame, tilossomos do tipo lamelar, exoderme com parede fina ou espessada em "o", e medula esclerificada. specklinia apresenta velame biestratificado com espessamento em "o" no epivelame, tilossomos, exoderme com paredes finas, e medula esclerificada. stelis apresenta velame biestratificado com espessamento reticulado no epivelame e espessamento helicoidal no endovelame, tilossomo lamelar, exoderme espessada em "o" ou não espessada, e medula esclerificada. zootrophion apresenta velame biestratificado, com espessamento em "u" no epivelame e anastomosado no endovelame, tilossomo do tipo discoide, exoderme com paredes finas, e medula esclerificada. nossos resultados sugerem que as características anatômicas radiculares são potencialmente úteis para esclarecer as diferenças taxonômicas, e que representam uma ferramenta adicional para distinguir os gêneros na subtribo pleurothallidinae.