As macrófitas aquáticas são reconhecidamente apontadas como elementos de suma importância para a manutenção da dinâmica limnológica e da biodiversidade em ecossistemas de água doce. embora esse grupo de organismos apresente relativamente poucos trabalhos cujos objetivos são inerentes ao conhecimento de sua biodiversidade na américa do sul, o reconhecimento de parâmetros biogeográficos para essas espécies é algo novo e experimental. objetivou-se nesse trabalho fornecer dados florísticos de três lagoas situadas no litoral de santa catarina, bem como, efetuar o primeiro trabalho de distribuição biogeográfica das macrófitas aquáticas da américa do sul. dados florísticos das lagoas catarinenses foram coletados durante o período de verão de 2013 e 2014. já a análise biogeográfica envolveu a compilação de levantamentos de macrófitas aquáticas realizadas em lagoas da américa do sul estabelecendo uma matriz de presença/ausência de espécies. posteriormente aplicou-se uma análise de correlação de espécies de macrófitas averiguando se sua distribuição estava mais bem correspondida ao seu bioma, província biogeográfica, vegetação, clima ou bacia hidrográfica. foram encontradas na análise florística 74 espécies para a lagoa pequena, 56 para o lago azul e 54 para lagoa doce. a análise com enfoque sobre a distribuição biogeográfica das espécies de macrófitas aquáticas em lagoas da américa do sul mostrou que lagoas em regiões mais temperadas ou andinas de altitude apresentavam a distribuição de suas espécies supostamente melhor relacionadas ao bioma em que se encontravam, enquanto que lagoas tropicais apresentavam uma melhor correspondência na sua distribuição quando estas pertencem a uma mesma vegetação.