Os septos são estruturas de osso cortical, localizados no interior dos seios maxilares, que dividem parcialmente estas estruturas. a presença do septo configura um obstáculo adicional na cirurgia de levantamento do assoalho do seio maxilar, pois aumenta o risco de perfuração da membrana sinusal assim como dificulta a visualização e o acesso adequados de toda a extensão do seio maxilar, o que pode causar um enxerto incompleto. os exames mais utilizados para a avaliação de septo são a radiografia panorâmica e as reconstruções multiplanares da tomografia computadorizada de feixe cônico (tcfc). o objetivo deste estudo foi avaliar a capacidade diagnóstica da radiografia panorâmica, da reconstrução panorâmica da tcfc e das imagens transversais quando comparadas com a imagem axial em detectar a presença, localização e orientação do septo em seio maxilar. para a análise da associação das variáveis foi utilizado o teste de chi quadrado ou exato de fischer. o nível de significância adotado foi ? < 0,05. para o diagnóstico de presença ou ausência de septo a radiografia panorâmica (7,1%) e a reconstrução panorâmica da tcfc (4,2%) foram semelhantes à imagem axial, todavia as imagens transversais diferiram estatisticamente (12,1%). em relação ao diagnóstico da localização do septo, a radiografia panorâmica (35%), a reconstrução panorâmica da tcfc (33,3%) e as imagens transversais (29,3%) foram diferentes estatisticamente da imagem axial. no diagnóstico da orientação do septo a radiografia panorâmica (1,4% ântero posterior 64,1% bucopalatal), a reconstrução panorâmica da tcfc (27,3% e 72,4% bucopalatal) e as imagens transversais (0,9% ínfero superior, 9,1% ântero posterior e 90,9% bucopalatal) diferiram estatisticamente da imagem axial. conclui-se que, a radiografia panorâmica, a reconstrução panorâmica da tcfc e as imagens transversais não fornecem as informações necessárias para a localização e orientação de septo em seio maxilar.